华蓥境域古属梁州地，春秋战国时期为巴国属地，秦朝首立郡县制后，市境隶属及所属政区名随朝代更迭和政区建置调整屡有变更。

1964年，华蓥山中段被国家选定为“三线建设”工业基地。1965-1978年，沿华蓥山中段西麓北起禄市镇，南至溪口镇先后建起6个国有军工企业、2个省属军工企业及一批原煤、水泥生产企业。至1978年初，此区域发展成为国家三线建设光学仪器、机械加工工业基地和川东北能源建材基地。

1978年3月9日，中共南充地委向中共四川省委、四川省革命委员会呈报《关于建立中共华蓥工农示范区委员会、华蓥工农示范区革命委员会的报告》，4月8日中共四川省委、四川省革命委员会批准筹建。6月1日，中共南充地委、南充地区行政公署成立华蓥工农示范区筹建处。11月10日，经中共四川省委和四川省革命委员会批准，成立中共华蓥工农示范区委员会和华蓥工农示范区革命委员会，隶属南充地区行政公署管辖，区委、区革委驻双河场。华蓥工农示范区区划经省委批准，辖广安县东南的永兴、回龙、双河、古桥、三圣、铜堡、天池、明月、禄市和岳池县西南的庆华、溪口、鸡心、新合、福星、阳和、高兴和庆华镇等1镇16个人民公社。

1979年10月5日，经国务院批准，设立县一级华云工农区。行政区划为原华蓥工农示范区区划。

1983年3月3日，国务院同意四川省发挥大中城市作用调整行政区划，将“南充地区的华云工农区划归重庆市管辖”。9月9日，国务院同意四川省调整行政区划，“华云工农区仍划归南充地区管辖”。

1985年2月4日，国务院批复撤销华云工农区，设立华蓥市（县级），以原华云工农区的行政区域为华蓥市的行政区域。

1993年7月2日，经国务院批准，设立广安地区，华蓥市划归广安地区管辖。1998年7月31日，国务院批复撤销广安地区，设立广安市（地级），华蓥市由省直辖。9月14日，四川省人民政府委托广安市代管华蓥市。